新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）

作者: [美] 吴著 , C.Chen 著

出版社: 科学出版社

出版时间: 2013-03

版次: 01

ISBN: 9787030369901

定价: 120.00

装帧: 平装

开本: 16开

纸张: 胶版纸

页数: 404页

正文语种: 英语

丛书: 新生物学丛书

分类: 自然科学

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　　随着蛋白质组学技术自身及其在生命科学与医学应用中的快速发展，许多生物信息学方法、数据库和软件被开发出来并成功用于比较蛋白质组学研究。在《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》中，专家描述了相关领域中最新的现状、挑战、所面临的开放性问题、以及未来的发展趋势。《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》内容涉及发展比较蛋白质组学研究所需的生物信息学工具和资源，为了解该领域提供了具有相当广度和深度的知识体系和引用参考。这些对于在实验中获得理想的结果至关重要。《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》内容全面、易于使用，对所有希望了解蛋白质组学数据分析和系统生物学层面上比较蛋白质组学的生物信息学数据库、工具、新计算方法及其未来发展趋势的读者都有所裨益。 Cathy H. Wu

美国特拉华州纽瓦克市，特拉华大学，特拉华生物技术研究所计算机与信息科学系

Chuming Chen

美国特拉华州纽瓦克市，特拉华大学，特拉华生物技术研究所计算机与信息科学系 Preface

Contributors

PARTI：BIOINFORMATICSFRAMEWORKFORCOMPARATIVEPROTEOMICS

1ProteinBioinformaticsDatabasesandResources

ChurningChen，HongzhanHuang，andCathyH．Wu

2AGuidetoUniProtforProteinScientists

ClaireO'DonovanandRolfApweiler

3InterProProteinClassification

JenniferMcDowallandSarahHunter

4ReactomeKnowledgebaseofHumanBiological

PathwaysandProcesses

PeterD'Eustachio

5eFIP：AToolforMiningFunctionalImpact

ofPhosphorylationfromLiterature

CeciliaN．Arighi，AmyY．Siu，CatalinaO．Tudor，

JulesA．Nchoutrnboube，CathyIt．Wu，andVijayK．Shanker

6ATutorialonProteinOntologyResourcesforProteomicStudies

CeciliaN．Arighi

7Structure-GuidedRule-BasedAnnotation．ofProtein

FunctionalSitesinUniProtKnowledgebase

SonaVasudevan，C．R．Vinayaka，DarrenA．Natale，

HongzhanHuang，RobelY．Kahsay，andCathyH．Wu

PARTII：PROTEOMICBIOINFORMATICS

8ModelingMassSpectrometry-BasedProteinAnalysis

JanErikssonandDavidFeny

9ProteinIdentificationfromTandemMassSpectra

byDatabaseSearching

NathanJ．Edwards

10LC-MSDataAnalysisforDifferential

ProteinExpressionDetection

RencyS．VargheseandHabtornW．Ressom

11ProteinIdentificationbySpectralNetworksAnalysis

NunoBandeira

12SoftwarePipelineandDataAnalysisforMS/MSProteomics：

TheTrans-ProteomicPipeline

AndrewKellerandDavidShteynberg

13AnalysisofHigh-ThroughputELISAMicroarrayData

AmandaM．White，DonS．Daly，andRichardC．Zangar

14ProteomicsDatabasesandRepositories

LennartMartens

15PreparingMolecularInteractionDataforPublication

SandraOrchardandHenningHermjakob

16SubmittingProteomicsDatatoPRIDEUsingPRIDEConverter

HaraldBarsnes，JuanAntonioVizcalno，FlorianReisinger，

IngvarEidhammer，andLennartMartens

17AutomatedDataIntegrationandDeterminationof

PosttranslationalModificationswiththeProteinInferenceEngine

StuartR．JefferysandMorganC．Giddings

18AnIntegratedTop-DownandBottom-UpStrategy

forCharacterizationofProteinIsoformsandModifications

SiWu，NikolaToli，ZhixinTian，ErrolW．Robinson，

andLjiljanaPaa-Toli

PARTIII：COMPARATIVEPROTEOMICSINSYSTEMSBIOLOGY

19PhosphoproteomeResourceforSystemsBiologyResearch

BerndBodenmillerandRuediAebersold

20Protein-CentricDataIntegrationforFunctionalAnalysisof

ComparativeProteomicsData

PeterB．McGarvey，JianZhang，DarrenA．Natale，

CathyH．Wu，andHongzhanHuang

21IntegrationofProteomicandMetabolomicProfiling

aswellasMetabolicModelingfortheFunctional

AnalysisofMetabolicNetworks

PatrickMay，NilsChristian，OliverEbenhh，

WolframWeckwerth，andDirkWalther

22TimeSeriesProteomeProfiling

CatherineA．Formolo，MichelleMint4AsakoTakanohashi，

KristyJ．Brown，AdelineVanderver，BrianHalligan，

andYetribHathout

Index
内容简介:
　　随着蛋白质组学技术自身及其在生命科学与医学应用中的快速发展，许多生物信息学方法、数据库和软件被开发出来并成功用于比较蛋白质组学研究。在《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》中，专家描述了相关领域中最新的现状、挑战、所面临的开放性问题、以及未来的发展趋势。《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》内容涉及发展比较蛋白质组学研究所需的生物信息学工具和资源，为了解该领域提供了具有相当广度和深度的知识体系和引用参考。这些对于在实验中获得理想的结果至关重要。《新生物学丛书：比较蛋白质组学的生物信息学（影印版）》内容全面、易于使用，对所有希望了解蛋白质组学数据分析和系统生物学层面上比较蛋白质组学的生物信息学数据库、工具、新计算方法及其未来发展趋势的读者都有所裨益。
作者简介:
Cathy H. Wu

美国特拉华州纽瓦克市，特拉华大学，特拉华生物技术研究所计算机与信息科学系

Chuming Chen

美国特拉华州纽瓦克市，特拉华大学，特拉华生物技术研究所计算机与信息科学系
目录:
Preface

Contributors

PARTI：BIOINFORMATICSFRAMEWORKFORCOMPARATIVEPROTEOMICS

1ProteinBioinformaticsDatabasesandResources

ChurningChen，HongzhanHuang，andCathyH．Wu

2AGuidetoUniProtforProteinScientists

ClaireO'DonovanandRolfApweiler

3InterProProteinClassification

JenniferMcDowallandSarahHunter

4ReactomeKnowledgebaseofHumanBiological

PathwaysandProcesses

PeterD'Eustachio

5eFIP：AToolforMiningFunctionalImpact

ofPhosphorylationfromLiterature

CeciliaN．Arighi，AmyY．Siu，CatalinaO．Tudor，

JulesA．Nchoutrnboube，CathyIt．Wu，andVijayK．Shanker

6ATutorialonProteinOntologyResourcesforProteomicStudies

CeciliaN．Arighi

7Structure-GuidedRule-BasedAnnotation．ofProtein

FunctionalSitesinUniProtKnowledgebase

SonaVasudevan，C．R．Vinayaka，DarrenA．Natale，

HongzhanHuang，RobelY．Kahsay，andCathyH．Wu

PARTII：PROTEOMICBIOINFORMATICS

8ModelingMassSpectrometry-BasedProteinAnalysis

JanErikssonandDavidFeny

9ProteinIdentificationfromTandemMassSpectra

byDatabaseSearching

NathanJ．Edwards

10LC-MSDataAnalysisforDifferential

ProteinExpressionDetection

RencyS．VargheseandHabtornW．Ressom

11ProteinIdentificationbySpectralNetworksAnalysis

NunoBandeira

12SoftwarePipelineandDataAnalysisforMS/MSProteomics：

TheTrans-ProteomicPipeline

AndrewKellerandDavidShteynberg

13AnalysisofHigh-ThroughputELISAMicroarrayData

AmandaM．White，DonS．Daly，andRichardC．Zangar

14ProteomicsDatabasesandRepositories

LennartMartens

15PreparingMolecularInteractionDataforPublication

SandraOrchardandHenningHermjakob

16SubmittingProteomicsDatatoPRIDEUsingPRIDEConverter

HaraldBarsnes，JuanAntonioVizcalno，FlorianReisinger，

IngvarEidhammer，andLennartMartens

17AutomatedDataIntegrationandDeterminationof

PosttranslationalModificationswiththeProteinInferenceEngine

StuartR．JefferysandMorganC．Giddings

18AnIntegratedTop-DownandBottom-UpStrategy

forCharacterizationofProteinIsoformsandModifications

SiWu，NikolaToli，ZhixinTian，ErrolW．Robinson，

andLjiljanaPaa-Toli

PARTIII：COMPARATIVEPROTEOMICSINSYSTEMSBIOLOGY

19PhosphoproteomeResourceforSystemsBiologyResearch

BerndBodenmillerandRuediAebersold

20Protein-CentricDataIntegrationforFunctionalAnalysisof

ComparativeProteomicsData

PeterB．McGarvey，JianZhang，DarrenA．Natale，

CathyH．Wu，andHongzhanHuang

21IntegrationofProteomicandMetabolomicProfiling

aswellasMetabolicModelingfortheFunctional

AnalysisofMetabolicNetworks

PatrickMay，NilsChristian，OliverEbenhh，

WolframWeckwerth，andDirkWalther

22TimeSeriesProteomeProfiling

CatherineA．Formolo，MichelleMint4AsakoTakanohashi，

KristyJ．Brown，AdelineVanderver，BrianHalligan，

andYetribHathout

Index