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新一代基因组测序：通往个性化医疗

新一代基因组测序：通往个性化医疗
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作者: [德] 著 , 译
出版社: 科学出版社
2012-01
版次: 1
ISBN: 9787030330079
定价: 98.00
装帧: 平装
开本: 16开
纸张: 胶版纸
页数: 228页
字数: 312千字
正文语种: 简体中文
丛书: 生物信息学数据分析丛书
分类: 自然科学
56人买过
  • 　　与传统测序技术相比，新一代测序（NGS）技术具有超高速、高通量、低成本和高效益的强大优势；这种新兴技术的研发和新一代测序平台的建立对基因组研究、人类健康和社会认知都产生了重大影响，是当今前沿科学发展最为迅猛的领域。《生物信息学数据分析丛书·新一代基因组测序：通往个性化医疗》包括5个部分18章。第一部分和第二部分分别概述了传统的SangerDNA测序和新一代测序平台的工作原理、方法和特点；第三部分剖析了困扰测序技术瓶颈及其解决方案；第四部分介绍了测序的商业化应用和新兴的测序平台；第五部分探讨了新一代测序技术在基因组学研究中的广泛应用。
    　　《生物信息学数据分析丛书·新一代基因组测序：通往个性化医疗》由参与NGS技术开发和应用的研究人员和发明家撰写，是全球第一本介绍新一代DNA测序技术的书。可作为高等院校生物学、医学、农学等领域的师生和研究人员学习参考用书，也对希望了解个人基因组信息、个性化医疗、伦理学等问题的读者有启迪和帮助作用。 译者序
    前言
    第一部分SangerDNA测序
    1SangerDNA测序
    1.1Sanger测序的基础
    1.2人类基因组计划的未来
    1.3局限性以及未来的机会
    1.4生物信息学是关键
    1.5下一步将往哪里走

    第二部分新一代测序：通往个性化医疗
    2lllumina基因组分析仪Ⅱ系统
    2.1文库的制备
    2.2簇的创建
    2.3测序
    2.4配对末端读序列
    2.5数据分析
    2.6应用
    2.7结论
    3应用系统生物公司（ABI）sOLDTM系统：基于连接的测序
    3.1引言
    3.2SOLIDTM系统概述
    3.3SOLIDTu系统应用
    3.4结论
    4新一代基因组测序：454／RocheGSFLX
    4.1引言
    4.2技术概述
    4.3软件和生物信息学
    4.4研究应用
    5聚合酶克隆测序：历史、技术及应用
    5.1介绍
    5.2聚合酶克隆测序的历史
    5.3聚合酶克隆测序
    5.4应用
    5.5结论

    第三部分瓶颈：序列数据分析
    6新一代测序（NGS）数据分析
    6.1为什么新一代序列分析有所不同？
    6.2序列搜索策略
    6.3什么是击中，为什么它对NGS十分重要？
    6.4记分：为什么NGS的记分不同？
    6.5NGS序列分析的策略
    6.6后续数据分析
    7DNASTAR的新一代软件
    7.1个人基因组及个性化医疗
    7.2新一代DNA测序——作为个性化基因组学的方法
    7.3不同平台的优势
    7.4计算机挑战
    7.5DNASTAR的新一代软件解决方案
    7.6结论

    第四部分新兴测序技术
    8实时DNA测序
    8.1全基因组分析
    8.2个性化医疗和药物基因组学
    8.3生物防御、法医、DNA测试和基础研究
    8.4简单精巧：实时DNA测序
    9使用Z型DNA分子替换的TEM直接测序
    9.1引言
    9.2方法的逻辑性
    9.3优化改良核苷酸鉴定技术进行DNA序列单独聚合的TEM目力分辨率
    9.4TEM基板和可视化
    9.5利用聚合酶进行z一标签核苷酸整合
    9.6当前和新的测序技术
    9.7精度
    9.8zs遗传学公司提出的DNA测序技术的优势
    9.9更长读序列的优势
    10单分子DNA条形码方法及其在DNA图谱和分子单体型中的应用
    10.1引言
    10.2单分子DNA条形码方法中的关键技术
    10.3单分子：DNA图谱
    10.4分子单体型
    10.5讨j沦
    11光学测序：从图像化的单分子模板采集
    11.1引言
    11.2光学测序循环
    11.3光学测序的展望
    12基于微芯片的SangerDNA测序
    12.1基因组学分析的集成微流体装置
    12.2Sanger测序微流体器件上网络聚合物的改进
    12.3结论

    第五部分新一代测序：真实地整合基因组分析
    13应用配对末端双标签多重测序进行转录组和基因组分析
    13.1引言
    13.2配对末端双标签（PET）分析的发展
    13.3利用GIS-PET进行转录组分析
    13.4利用ChIP-PET在全基因组上定位转录因子结合位点和表观遗传修饰
    13.5利用ChIA-PET在全基因组上鉴定长距离互作
    13.6展望
    14利用454测序平台研究古基因组学
    14.1引言
    14.2DNA降解的挑战
    14.3DNA降解对古基因组学研究的影响
    14.4降解与测序的准确性
    14.5样品污染
    14.6解决DNA损伤的方法
    14.7解决污染的方法
    14.8还存在哪些基本问题，将来的前景如何
    15ChIP-seq：蛋白质-DNA互作作图
    15.1引言
    15.2历史
    15.3染色质免疫沉淀测序（chIP-seq）方法
    15.4基于双脱氧标签Sanger测序
    15.5基于杂交的标签测序
    15.6边合成边测序的应用
    15.7ChIP.seq的医学应用
    15.8挑战
    15.9ChIP-seq方法的展望
    16新一代测序技术在MicroRNA的发现和表达谱研究中的应用
    16.1miRNA的背景介绍
    16.2miRNA的鉴定
    16.3实验方法
    16.4验证
    16.5展望
    17基于标签的转录组学分析DeepSAGE，优于微阵列
    17.1引言
    17.2DeepSAGE
    17.3数据分析
    17.4基于标签的转录组表达谱的比较
    17.5表达谱未来的展望
    18新基因组学和个人基因组信息：伦理学问题
    18.1新基因组学和个人基因组信息：伦理学问题
    18.2新基因组学：它的特点是什么？
    18.3伦理学的革新：为什么我们需要它？
    18.4限制条款：全基因组学和本地伦理学观
    18.5医学伦理学和希波克拉底保密性
    18.6生物医学伦理学的原则
    18.7临床研究和知后同意
    18.8大规模研究伦理学：新观念
    18.9个人基因组
    18.10个人基因组计划：允许信息公开
    英汉对照词汇
    彩图
  • 内容简介:
    　　与传统测序技术相比，新一代测序（NGS）技术具有超高速、高通量、低成本和高效益的强大优势；这种新兴技术的研发和新一代测序平台的建立对基因组研究、人类健康和社会认知都产生了重大影响，是当今前沿科学发展最为迅猛的领域。《生物信息学数据分析丛书·新一代基因组测序：通往个性化医疗》包括5个部分18章。第一部分和第二部分分别概述了传统的SangerDNA测序和新一代测序平台的工作原理、方法和特点；第三部分剖析了困扰测序技术瓶颈及其解决方案；第四部分介绍了测序的商业化应用和新兴的测序平台；第五部分探讨了新一代测序技术在基因组学研究中的广泛应用。
    　　《生物信息学数据分析丛书·新一代基因组测序：通往个性化医疗》由参与NGS技术开发和应用的研究人员和发明家撰写，是全球第一本介绍新一代DNA测序技术的书。可作为高等院校生物学、医学、农学等领域的师生和研究人员学习参考用书，也对希望了解个人基因组信息、个性化医疗、伦理学等问题的读者有启迪和帮助作用。
  • 目录:
    译者序
    前言
    第一部分SangerDNA测序
    1SangerDNA测序
    1.1Sanger测序的基础
    1.2人类基因组计划的未来
    1.3局限性以及未来的机会
    1.4生物信息学是关键
    1.5下一步将往哪里走

    第二部分新一代测序：通往个性化医疗
    2lllumina基因组分析仪Ⅱ系统
    2.1文库的制备
    2.2簇的创建
    2.3测序
    2.4配对末端读序列
    2.5数据分析
    2.6应用
    2.7结论
    3应用系统生物公司（ABI）sOLDTM系统：基于连接的测序
    3.1引言
    3.2SOLIDTM系统概述
    3.3SOLIDTu系统应用
    3.4结论
    4新一代基因组测序：454／RocheGSFLX
    4.1引言
    4.2技术概述
    4.3软件和生物信息学
    4.4研究应用
    5聚合酶克隆测序：历史、技术及应用
    5.1介绍
    5.2聚合酶克隆测序的历史
    5.3聚合酶克隆测序
    5.4应用
    5.5结论

    第三部分瓶颈：序列数据分析
    6新一代测序（NGS）数据分析
    6.1为什么新一代序列分析有所不同？
    6.2序列搜索策略
    6.3什么是击中，为什么它对NGS十分重要？
    6.4记分：为什么NGS的记分不同？
    6.5NGS序列分析的策略
    6.6后续数据分析
    7DNASTAR的新一代软件
    7.1个人基因组及个性化医疗
    7.2新一代DNA测序——作为个性化基因组学的方法
    7.3不同平台的优势
    7.4计算机挑战
    7.5DNASTAR的新一代软件解决方案
    7.6结论

    第四部分新兴测序技术
    8实时DNA测序
    8.1全基因组分析
    8.2个性化医疗和药物基因组学
    8.3生物防御、法医、DNA测试和基础研究
    8.4简单精巧：实时DNA测序
    9使用Z型DNA分子替换的TEM直接测序
    9.1引言
    9.2方法的逻辑性
    9.3优化改良核苷酸鉴定技术进行DNA序列单独聚合的TEM目力分辨率
    9.4TEM基板和可视化
    9.5利用聚合酶进行z一标签核苷酸整合
    9.6当前和新的测序技术
    9.7精度
    9.8zs遗传学公司提出的DNA测序技术的优势
    9.9更长读序列的优势
    10单分子DNA条形码方法及其在DNA图谱和分子单体型中的应用
    10.1引言
    10.2单分子DNA条形码方法中的关键技术
    10.3单分子：DNA图谱
    10.4分子单体型
    10.5讨j沦
    11光学测序：从图像化的单分子模板采集
    11.1引言
    11.2光学测序循环
    11.3光学测序的展望
    12基于微芯片的SangerDNA测序
    12.1基因组学分析的集成微流体装置
    12.2Sanger测序微流体器件上网络聚合物的改进
    12.3结论

    第五部分新一代测序：真实地整合基因组分析
    13应用配对末端双标签多重测序进行转录组和基因组分析
    13.1引言
    13.2配对末端双标签（PET）分析的发展
    13.3利用GIS-PET进行转录组分析
    13.4利用ChIP-PET在全基因组上定位转录因子结合位点和表观遗传修饰
    13.5利用ChIA-PET在全基因组上鉴定长距离互作
    13.6展望
    14利用454测序平台研究古基因组学
    14.1引言
    14.2DNA降解的挑战
    14.3DNA降解对古基因组学研究的影响
    14.4降解与测序的准确性
    14.5样品污染
    14.6解决DNA损伤的方法
    14.7解决污染的方法
    14.8还存在哪些基本问题，将来的前景如何
    15ChIP-seq：蛋白质-DNA互作作图
    15.1引言
    15.2历史
    15.3染色质免疫沉淀测序（chIP-seq）方法
    15.4基于双脱氧标签Sanger测序
    15.5基于杂交的标签测序
    15.6边合成边测序的应用
    15.7ChIP.seq的医学应用
    15.8挑战
    15.9ChIP-seq方法的展望
    16新一代测序技术在MicroRNA的发现和表达谱研究中的应用
    16.1miRNA的背景介绍
    16.2miRNA的鉴定
    16.3实验方法
    16.4验证
    16.5展望
    17基于标签的转录组学分析DeepSAGE，优于微阵列
    17.1引言
    17.2DeepSAGE
    17.3数据分析
    17.4基于标签的转录组表达谱的比较
    17.5表达谱未来的展望
    18新基因组学和个人基因组信息：伦理学问题
    18.1新基因组学和个人基因组信息：伦理学问题
    18.2新基因组学：它的特点是什么？
    18.3伦理学的革新：为什么我们需要它？
    18.4限制条款：全基因组学和本地伦理学观
    18.5医学伦理学和希波克拉底保密性
    18.6生物医学伦理学的原则
    18.7临床研究和知后同意
    18.8大规模研究伦理学：新观念
    18.9个人基因组
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